Am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse der Fakultät für Angewandte Informatik der Universität Augsburg ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Stelle als

wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d)
mit der Möglichkeit zur Promotion
 

im Umfang der regelmäßigen Arbeitszeit in einem für zunächst ein Jahr befristeten Beschäftigungsverhältnis zu besetzen. Die Vergütung erfolgt bei Vorliegen der persönlichen und tariflichen Vorraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TV-L, möglicherweise auch in Teilzeit.

Die Forschung am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse zielt darauf ab, quantitative Systemmodelle mit KI/Machine Learning zu verknüpfen, um neuartige therapeutische Strategien für die Krebs und andere Krankheiten zu entdecken. Mit einem Fokus auf Deep-Learning-Techniken streben wir an, groß angelegte Datensätze nahtlos mit Patientenergebnissen zu integrieren, um dadurch komplexe Krankheitsdynamiken und therapeutische Reaktionen zu entschlüsseln. Dabei verwenden wir innovative Technologien wie Einzelzellsequenzierung und Deep Learning, um die Komplexität der Krankheitsbiologie zu enträtseln und klinisch relevante Erkenntnisse zu gewinnen.

Wir fördern die interdisziplinäre Zusammenarbeit durch offene Kommunikation und Karriereplanung, um sicherzustellen, dass Wissenschaftler aus verschiedenen Bereichen produktiv zusammenarbeiten können.

Ihr Aufgabengebiet:

• Analyse biomedizinischer Datenanalysen, wie zum Beispiel zeitaufgelöste Proteomics Daten, genomische Datensätze (RNA/DNA), oder single-cell RNA Sequencing um Forschungsfragen zu beantworten.
• Import, Bereinigung und Integration von Datensätzen für computergestützte Analysen mittels Machine Learning Tools.
• Hilfe beim Aufbau einer computergestützten Infrastruktur, die der nachhaltigen Datenanalyse und auch der Entwicklung von Tools und Methoden dient, die Speicherung großer Datensätze und die gleichzeitige Abfrage mehrerer Datensätze ermöglicht.
• Erstellen hochwertiger wissenschaftlicher und/oder technischer Arbeiten, die für die Veröffentlichung in renommierten Fachzeitschriften und für die Präsentation auf nationalen und internationalen Konferenzen geeignet sind.
• Sie halten sich über neu veröffentlichte Methoden der Systems Biology und des Machine Learnings auf dem Laufenden.
• Koordination von Projekten oder Projektkomponenten, nach Bedarf sowie die Vorbereitung technischer Projektberichte, nach Bedarf. 
• Coaching und Mentoring von technischem Personal, Studierenden und Nachwuchswissenschaftlern sowie Mitarbeit im Team Building
• Teilnahme an Planung und Durchführen von Lehrveranstaltungen und Unterstützung der Aufgaben der akademischen Selbstverwaltung des Lehrstuhls, gemäß BayHIG.

Ihr Profil:

• Ein Master- oder Diplomabschluss in einem relevanten Fachgebiet wie Systems Biology, Computational Biology, Data Science, Physik, Informatik, Ingenieurwesen, Statistik, Mathematik oder anderen verwandten Fachbereichen.
• Ein Nachweis wissenschaftlicher Innovation und Kreativität sowie die Fähigkeit und Bereitschaft, neuartige Ideen und Ansätze in wissenschaftliche Untersuchungen einzubeziehen, idealerweise durch entsprechende Publikationen belegt.
• Vorzugsweise Erfahrung in der Analyse von zeitaufgelöste Daten mittels Differentialgleichungsmodellen, oder dem Einsatz von Machine Learning Modellen die durch abgeschlossene Projekte nachgewiesen werden. Sicherheit bei der Durchführung von computergestützten Analysen, Fehlerbehebung und Dokumentation.
• Programmierkenntnisse, zum Beispiel mit Python (bevorzugt), MATLAB oder R, solide Kenntnis der Best Practice für Programmierung.
• Sehr gute schriftliche und mündliche Kommunikationsfähigkeiten in Englisch, einschließlich der Fähigkeit, Forschungsergebnisse zu veröffentlichen, Berichte zu erstellen und die Ergebnisse wissenschaftlicher Untersuchungen auf nationalen und internationalen Konferenzen und Stakeholder-Treffen zu präsentieren.
• Die Fähigkeit, als Teil eines multidisziplinären Forschungsteams sowie mit externen Forschern, auch international, effektiv zu arbeiten und unabhängige individuelle Forschung durchzuführen, um zu gemeinsamen Forschungszielen der Arbeitsgruppe und des Projektteams beizutragen
• Aufgeschlossenheit, Teamfähigkeit, Flexibilität sowie die Fähigkeit zu selbstständigem und eigenverantwortlichem Arbeiten
• Loyalität, Verlässlichkeit und hohe Vertrauenswürdigkeit
• sicherer Umgang mit Internet, E-Mail und den aktuellen Office-Anwendungen (Word, PowerPoint, Excel) sowie die Bereitschaft, sich hier weiterzubilden

Wir bieten:

• einen attraktiven und sicheren Arbeitsplatz,
• ein interessantes und abwechslungsreiches Aufgabengebiet im dynamischen, multikulturellen Umfeld einer Universität,
• Möglichkeiten zu eigenständigem Arbeiten in einem engagierten Team,
• eine offene und wertschätzende Arbeitsatmosphäre mit persönlichem Arbeitsplatz,
• eine familienfreundliche Arbeitszeitgestaltung mit Homeofficeregelungen und gleitenden Arbeitszeiten,
• umfangreiche Förderung von Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten,
• Jahressonderzahlungen und eine betriebliche Altersversorgung (VBL) und
• die Möglichkeit, verschiedene universitäre Einrichtungen zu nutzen (z.B. Hochschulsport, Gesundheitsförderung, Sprachkurse)

Die erforderliche Qualifikation ist bereits in den Bewerbungsunterlagen durch entsprechende Zeugnisse nachzuweisen.

Die Universität Augsburg fördert die berufliche Gleichstellung von Frauen. Frauen werden ausdrücklich aufgefordert, sich zu bewerben. Die Universität Augsburg setzt sich besonders für die Vereinbarkeit von Familie und Erwerbsleben ein. Für mehr Informationen wenden Sie sich bitte an die Frauenbeauftragte der Fakultät.

Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber (m/w/d) werden bei ansonsten im Wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt eingestellt.

Haben wir Ihr Interesse geweckt? Dann freuen wir uns über Ihre aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf) bitte nur per E-Mail in Form einer einzigen PDF-Datei bitte bis spätestens

31. August 2024

an:
Prof. Dr. Andreas Raue
Professur für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse
Universität Augsburg
Gutenbergstr. 7
86356 Neusäß
E-Mail: andreas.raue@uni-a.de